More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3693 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 378 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  61.11 
 
 		 378 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  60.85 
 
 		 378 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  60.05 
 
 		 378 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  59.79 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  60.05 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  60.05 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  59.79 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  59.79 
 
 		 378 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  60.05 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  60.05 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  59.52 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  59.79 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  59.79 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  60.05 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  59.79 
 
 		 378 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  60.05 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  59.79 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  60.05 
 
 		 378 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  59.79 
 
 		 378 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  59.52 
 
 		 378 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  44.59 
 
 		 381 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  44.03 
 
 		 378 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  44.33 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  44.33 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  43.01 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  44.84 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 376 aa  334  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  43.12 
 
 		 376 aa  332  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  42.18 
 
 		 378 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  42.71 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  42.44 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  42.86 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  44.03 
 
 		 381 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  41.8 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  40.82 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  36.94 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  40.27 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  30.35 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  29.92 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  27.62 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  29.11 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  27.99 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  30.91 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  28.35 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  31.19 
 
 		 351 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  27.73 
 
 		 311 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  30.59 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  25.88 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  25 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  25.67 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  27.82 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  28.33 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  27.55 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.33 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.33 
 
 		 343 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.33 
 
 		 343 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  27.99 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.33 
 
 		 343 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  25.68 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  28.33 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  29.12 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  28.2 
 
 		 467 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  24.55 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  30.49 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  32.26 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  25.21 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  31.54 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.12 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  22.12 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  27.72 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  27.17 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  23.67 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  22.82 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  31.42 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  26.22 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  31.42 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>