More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3252 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 319 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  45.26 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  44.47 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 		 378 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  43.42 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  43.42 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  42.89 
 
 		 381 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  44.74 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  41.95 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  42.26 
 
 		 376 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  41.19 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  39.06 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  39.06 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  39.06 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  39.06 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  39.06 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  39.06 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  41.95 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  38.06 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  42.89 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  42.22 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  40.82 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 381 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 381 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 381 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  37.27 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  36.2 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  35.63 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  27.2 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 		 383 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  26.04 
 
 		 379 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  26.33 
 
 		 396 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  26.06 
 
 		 396 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  25.14 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  24.92 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  27.92 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  27.92 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5189  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.367271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.5 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.38 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  25.98 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  26.22 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  22.91 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  22.9 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.67 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  26.67 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  24.93 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  27.13 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  24.56 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  24.2 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  25.57 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  28.8 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4098  secretion protein HlyD family protein  24.55 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  26.54 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  27.35 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  28.05 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  28.05 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  28.05 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.05 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.6 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2925  hypothetical protein  24.7 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0831284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  21.78 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  28.24 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  28.63 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  30.61 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  25.87 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  25.87 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>