More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2977 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  100 
 
 		 313 aa  631  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  62.3 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  65.81 
 
 		 311 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  30.59 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  30.85 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  30.85 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  30.71 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  31.22 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  30.7 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  30.7 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  30.7 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  28.31 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  30.7 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.7 
 
 		 378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  31.27 
 
 		 376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  30.38 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  30.99 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  29.75 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  29.64 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  29.39 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  28.89 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  28.27 
 
 		 379 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  30.06 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  28.25 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  36.06 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  36.06 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  36.06 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 378 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  33.17 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  25.97 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  35.16 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  26.88 
 
 		 352 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  29.6 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  30.73 
 
 		 407 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  29.39 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  29.39 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 		 378 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  29.39 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  29.39 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.98 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  28.57 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  27.33 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  25.78 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  30.94 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.16 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  31.03 
 
 		 400 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0185  putative multidrug resistance efflux pump  32.21 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  28.8 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.27 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3992  secretion protein HlyD family protein  29.36 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  33.51 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  27.05 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  23.73 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  25.16 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  30.08 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  30.08 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.08 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  30.08 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  24.01 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.13 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.08 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.46 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.46 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.57 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  33.51 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  28.79 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  28.05 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  30.04 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  28.62 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  24.54 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  24.54 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.36 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  31.41 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  29.44 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>