More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05325 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  94.84 
 
 		 407 aa  794    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0205  putative multidrug resistance efflux pump  64.13 
 
 		 407 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3992  secretion protein HlyD family protein  62.41 
 
 		 407 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0185  putative multidrug resistance efflux pump  62.41 
 
 		 406 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  60.44 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  29.11 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.38 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  27.03 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  25.37 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.74 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  25.5 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  25.5 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  25.5 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  25.93 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  25.25 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  24.5 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  24.32 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  27.1 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  26.49 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  24.46 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  24.26 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  24.26 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.26 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  24.26 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  24.26 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.26 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  24.69 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  24.69 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  24.88 
 
 		 378 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  24.69 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  24.69 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  23.95 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  24.23 
 
 		 368 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  24.52 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  26.28 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  24.07 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  24.5 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  24.51 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  25 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  26.46 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  31.03 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  22.85 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  25.3 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  26.07 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  24.62 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  24.83 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  24.23 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  24.61 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  25.55 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  24.12 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  23.41 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  30.39 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  24.62 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  25.3 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  25.19 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  22.6 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  25.19 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  26.21 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  23.05 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  23.1 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  23.96 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  22.07 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  23.65 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  26.13 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  23.32 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  24.92 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  26.86 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  24.19 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  25.09 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  24.03 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  23.61 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  23.61 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  23.61 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  25.95 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  22.56 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>