More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0942 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  100 
 
 		 407 aa  832    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0205  putative multidrug resistance efflux pump  70.27 
 
 		 407 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0185  putative multidrug resistance efflux pump  67.81 
 
 		 406 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3992  secretion protein HlyD family protein  65.36 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  62.41 
 
 		 407 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  60.44 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  34.1 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  25.24 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  26.1 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  25.6 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  26.62 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  26.03 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  25.38 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  23.54 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 313 aa  86.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  24.39 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  23.97 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  22.3 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  22.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  22.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  22.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  22.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  22.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  22.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  22.3 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  30.94 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  23.28 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  23.79 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  26.24 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  22.68 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  21.69 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  25.36 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  24.13 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  26.95 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  23.54 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  23.54 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.51 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  23.54 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  23.54 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  23.54 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  27.38 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  26 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  25.38 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  25.38 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  22.14 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  22.49 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  24.33 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  22.49 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  22.49 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  22.49 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  24.63 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  24.57 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  22.49 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  24.44 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  24.44 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 463 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  27.52 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  23.32 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  26.63 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  21.27 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  22.38 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  25.08 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  25.08 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  23.11 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  26.39 
 
 		 354 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  27.82 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  23.3 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  23.62 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  23.38 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  25.25 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  26.47 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  22.31 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  21.07 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  24.12 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  24.09 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  23.88 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  23.05 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  23.94 
 
 		 364 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  26.4 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  24.07 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  22.81 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  26.51 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  23.85 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  23.96 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>