More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0115 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  80.95 
 
 		 378 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  80.95 
 
 		 378 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  80.42 
 
 		 378 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  82.54 
 
 		 378 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  83.07 
 
 		 378 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  80.95 
 
 		 378 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  80.95 
 
 		 378 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  80.95 
 
 		 378 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  80.95 
 
 		 378 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  80.95 
 
 		 378 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  80.95 
 
 		 378 aa  648    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 378 aa  768    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  74.6 
 
 		 378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  74.6 
 
 		 378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  74.34 
 
 		 378 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  74.6 
 
 		 378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  74.6 
 
 		 378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  74.34 
 
 		 378 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  74.6 
 
 		 378 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  74.34 
 
 		 378 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  61.11 
 
 		 378 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  48.02 
 
 		 381 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  48.02 
 
 		 381 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  48.02 
 
 		 381 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  48.02 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  48.02 
 
 		 381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  48.02 
 
 		 381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  47.48 
 
 		 378 aa  362  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  47.76 
 
 		 381 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  49.18 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  46.68 
 
 		 378 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  45.36 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  46.03 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  44.56 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  45.5 
 
 		 376 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  45.24 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  46.95 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  46.3 
 
 		 376 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  44.96 
 
 		 385 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  40.42 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 379 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  29.16 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  30.8 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  25.73 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  27.06 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  25.66 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  29.63 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  29.15 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  24.32 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  28.68 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.89 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  25.9 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  27.71 
 
 		 352 aa  93.2  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  23.34 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  27.51 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  25.66 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  25.9 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8072  fusaric acid resistance protein FusE  30.73 
 
 		 202 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  25.47 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  30.77 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  28.69 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  25 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  24.41 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  25.64 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  24.56 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  31.22 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0185  putative multidrug resistance efflux pump  22.79 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  28.29 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  26.69 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  26.69 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  26.69 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  26.69 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  26.69 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  26.69 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  26.29 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  26.29 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  24.27 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3992  secretion protein HlyD family protein  23.6 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0015  hypothetical protein  26.09 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  27.96 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0015  hypothetical protein  26.09 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  28.04 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  25.21 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  21.69 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>