More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3992 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0205  putative multidrug resistance efflux pump  79.12 
 
 		 407 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0185  putative multidrug resistance efflux pump  75.18 
 
 		 406 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3992  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 407 aa  837    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  65.36 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  64.13 
 
 		 407 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  62.41 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  25.89 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.98 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  27.34 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  28.09 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  28.57 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.07 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  29.84 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 313 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  23.6 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  29.36 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  23.61 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  23.61 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  24.21 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  26.86 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  25.28 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  22.89 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  24.72 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  22.87 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  26.62 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  25.07 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  23.08 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  23.08 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  23.08 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  23.08 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  23.08 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  23.08 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.08 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  23.08 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  23.95 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  22.28 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  23.1 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  26.85 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  25.97 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  25.32 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  22.6 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  22.6 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  22.6 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  22.6 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  28.3 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  22.6 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  24.14 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  26.36 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  26.17 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  22.36 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  24.25 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  22.73 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  22.6 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  22.41 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  26.42 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  26.34 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  22.3 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  22.78 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  22.44 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  22.44 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  23.66 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  22.44 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  23.66 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  24.41 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  24.81 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  25.91 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  23.37 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  22.44 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  27.75 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  23.48 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  23.13 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  22.44 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  23.19 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  27.17 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  23.93 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  21.46 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  22.75 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  22.43 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  23.4 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  26.72 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  27.61 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  20.73 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  25.25 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  23.75 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  21.74 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  22.89 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  24 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>