More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3434 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 352 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  99.43 
 
 		 352 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  95.74 
 
 		 352 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  92.72 
 
 		 357 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  89.2 
 
 		 352 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  89.2 
 
 		 352 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  89.2 
 
 		 352 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  88.92 
 
 		 352 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  87.78 
 
 		 352 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  75 
 
 		 356 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  64.2 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  61.93 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  61.36 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  52.27 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  51.99 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  46.22 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  44.92 
 
 		 354 aa  315  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  45.2 
 
 		 354 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 355 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  37.01 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  36.75 
 
 		 355 aa  232  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  34.74 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  30.84 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  31.52 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.55 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  31.07 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  30.79 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  32.42 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  31.28 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  29.75 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  29.75 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  29.75 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  29.46 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  31.85 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  32.34 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  30.09 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  30.09 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  27.93 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  31.12 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  31.48 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  29.05 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  31.19 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  32.53 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  26.81 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  31.16 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  29.85 
 
 		 354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  30.55 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  30.55 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  30.42 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  31.39 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  30.42 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  30.55 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  27.71 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  29.15 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  30.4 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  30.23 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  30.1 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  26.96 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  33.06 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  26.64 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.35 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.45 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  29.45 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.45 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  29.45 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.45 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.45 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  27.83 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  26.77 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  29.22 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  28.75 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  27.62 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  28.9 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  29.22 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  27.67 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.33 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.45 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.33 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.21 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.21 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  27.33 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>