More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0570 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  99.15 
 
 		 352 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 352 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  99.72 
 
 		 352 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  99.72 
 
 		 352 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  91.76 
 
 		 352 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  88.92 
 
 		 352 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  89.49 
 
 		 352 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  89.2 
 
 		 352 aa  594  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  87.39 
 
 		 357 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  77.84 
 
 		 356 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  62.5 
 
 		 352 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  62.78 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  60.51 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  51.7 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  51.42 
 
 		 352 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  46.22 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  45.48 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  37.32 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  36.72 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  35.05 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  31.81 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  29.68 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  31.01 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  30.88 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  31.56 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  29.63 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  29.23 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  31.84 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  30.18 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  28.69 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  28.9 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  28.9 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  30.38 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  27.38 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  31.12 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  27.51 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  30.46 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  32.89 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  33.22 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  30.46 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  35.71 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  32.34 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  28.96 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  24.42 
 
 		 379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  28.95 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  32.92 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  30.27 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  27.63 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  30.97 
 
 		 343 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  30.97 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  30.97 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  30.97 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  30.97 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  30.97 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  30.65 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  27.64 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  30.65 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.91 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  32.11 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  28.89 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 381 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  27 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  30.57 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  28.25 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  30.25 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  29.7 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  26.61 
 
 		 401 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  25.86 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 470 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 475 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 475 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  26.11 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  26.11 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  26.11 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  26.11 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.11 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.11 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>