More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06917 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  30.75 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  30.42 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  28.65 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  27.22 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  25.94 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  28.69 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  27.16 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  28.49 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  27.25 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  27.19 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  27.99 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  24.64 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  23.78 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  23.56 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  23.51 
 
 		 364 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  23.41 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  23.24 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  24.43 
 
 		 352 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  26.29 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  23.58 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  21.69 
 
 		 378 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  23.3 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  22.79 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  23.26 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  23.01 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  26.56 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  20.53 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  21.65 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  23.42 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  24.31 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  23.51 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  24.11 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  24.11 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  24.11 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  25 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  24.11 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.11 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  24.11 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.11 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  24.11 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  23.14 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  24.84 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  24.1 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  24.84 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  24.84 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  24.84 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  22.42 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  24.84 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  25.6 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  24.84 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  23.81 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  25.62 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  24.31 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  23.48 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  21.43 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  22.15 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.05 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  23.49 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  24.84 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  27.34 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  21.65 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  22.58 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  26.6 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  20.34 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  21.58 
 
 		 407 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  23.08 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  23.04 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  25.29 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  23.89 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0310  hypothetical protein  21.43 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  24.86 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  25.29 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0327  hypothetical protein  21.09 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  23.62 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  23.71 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  24.18 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  24 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  24.86 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  24.58 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>