More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0310 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0327  hypothetical protein  99.09 
 
 
330 aa  675    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0310  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  680    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0497  hypothetical protein  48.02 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0473  hypothetical protein  48.02 
 
 
345 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0015  hypothetical protein  46.27 
 
 
357 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0015  hypothetical protein  46.27 
 
 
357 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  27.52 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  27.22 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  27.04 
 
 
337 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 
337 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  25.15 
 
 
364 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  25.15 
 
 
364 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 
349 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  28.31 
 
 
351 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 
351 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  27.48 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  24 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  25.32 
 
 
364 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  25.44 
 
 
390 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  25.44 
 
 
390 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  26.09 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  25.44 
 
 
390 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  26.15 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 
374 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  23.87 
 
 
391 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  24.39 
 
 
402 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  23.56 
 
 
391 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  24.78 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  24.52 
 
 
395 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 
386 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 
402 aa  93.2  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  24.07 
 
 
402 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  23.95 
 
 
390 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  23.95 
 
 
390 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  23.95 
 
 
390 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  23.95 
 
 
390 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  23.95 
 
 
390 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  23.95 
 
 
390 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  23.95 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  25.44 
 
 
349 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  25.44 
 
 
349 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  25.44 
 
 
349 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  23.08 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  23.85 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  25.3 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  26.54 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  25.3 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  25.82 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  23.12 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  25.88 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  26.18 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  25.88 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  25.88 
 
 
390 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  26.91 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  25.46 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  23.47 
 
 
394 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  25.88 
 
 
390 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  25.74 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.74 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  25.74 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  25.74 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.74 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  25.74 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.66 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4503  secretion protein HlyD family protein  25.73 
 
 
396 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.44 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  23.65 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  25.67 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 
356 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  25.3 
 
 
288 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  25.44 
 
 
390 aa  89.4  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  26.52 
 
 
343 aa  89  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5028  secretion protein HlyD family protein  25.44 
 
 
396 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  23.58 
 
 
285 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  26.55 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  23.84 
 
 
390 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  21.81 
 
 
381 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  25.57 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  27.38 
 
 
327 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  25.77 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  23.15 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  26.8 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  25.52 
 
 
365 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  23.34 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  26.2 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  25.44 
 
 
387 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28 
 
 
311 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  24.2 
 
 
355 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  26.2 
 
 
343 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  26.2 
 
 
343 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28 
 
 
311 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28 
 
 
311 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  26.2 
 
 
343 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  26.25 
 
 
334 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>