More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0015 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0015  hypothetical protein  98.88 
 
 		 357 aa  723    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0015  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  728    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0310  hypothetical protein  46.27 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0327  hypothetical protein  45.65 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0473  hypothetical protein  43.94 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0497  hypothetical protein  43.87 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  28.83 
 
 		 331 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  28.53 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  27.6 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  27.6 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  27.6 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  26.27 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  27.3 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  27.51 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  27.22 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  26.63 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  28.53 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.53 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.53 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  28.53 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.53 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.53 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  28.53 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28.53 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  26.33 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  28.21 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  26.49 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  26.42 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  29.94 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  25.58 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.17 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  27.19 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 315 aa  93.2  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  24.03 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  27.83 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  27.83 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.73 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  26.27 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  27.14 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  24.1 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  24.8 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  27.63 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  25.79 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  28.25 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.45 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  26.98 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  26.33 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 383 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  25.54 
 
 		 285 aa  86.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  27.04 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  27.04 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.27 
 
 		 310 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  27.04 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  27.3 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.27 
 
 		 310 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.27 
 
 		 310 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  25.79 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.27 
 
 		 310 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  27.63 
 
 		 371 aa  86.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  27.73 
 
 		 288 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.27 
 
 		 310 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  26.24 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 		 407 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  23.62 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  26.91 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.91 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.91 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  28.33 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  26.91 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  26.91 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  25.54 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  23.91 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  26.5 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1853  multidrug resistance transmembrane protein  25.66 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  26.77 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  25.28 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  23.14 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>