More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1965 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  100 
 
 		 396 aa  801    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  98.99 
 
 		 396 aa  794    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5189  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.367271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2925  hypothetical protein  32.23 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0831284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1989  hypothetical protein  30.64 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4174  hypothetical protein  30.37 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4098  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  25.8 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  26.33 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.21 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  27.95 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  27.95 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  27.95 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  27.2 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  27.95 
 
 		 378 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  27.69 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  25.9 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  27.66 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  26.95 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  25.8 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  27.32 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  27.32 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  26.6 
 
 		 319 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  25.63 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  25.86 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  25.96 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  31.14 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  25.34 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  29.54 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  26.16 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  25.57 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  25.57 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  23.67 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  26.74 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  32.89 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  28.08 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  26.12 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  26.35 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  28.38 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  28.03 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  27.8 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  28.19 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  25.11 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  26.51 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  26.43 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  25.22 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  26.18 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  23.6 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  26.1 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  30.22 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  26.17 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  30 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  26.18 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  25.86 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  27.97 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  25.7 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.12 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  25 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  30.57 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  25.78 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  25.78 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  30.88 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  30.81 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>