More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1379 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
374 aa  733    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  42.74 
 
 
379 aa  297  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  26.22 
 
 
372 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  29.5 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  26.86 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 
393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 
375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  30.81 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  25.14 
 
 
374 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  26.06 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  26.17 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  26.51 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  27.3 
 
 
411 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 
368 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  25.52 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  29.34 
 
 
456 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  24.73 
 
 
394 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  28.27 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 
402 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 
411 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  26.49 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  25.4 
 
 
351 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  26.61 
 
 
413 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  27.49 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  26.27 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  23.99 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  26.6 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  24.6 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  26.12 
 
 
414 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  24.52 
 
 
393 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  25.69 
 
 
363 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  26.4 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  24.86 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.58 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  25.13 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  25.9 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  23.97 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 
347 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 
401 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  25.47 
 
 
365 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  28.75 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  25.53 
 
 
348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  23.98 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 
370 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  23.77 
 
 
358 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  24.87 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  24.93 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  24.2 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  24.2 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  23.98 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  26.03 
 
 
352 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  25.42 
 
 
368 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  25.07 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  26.35 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  23.71 
 
 
470 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 
351 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  23.71 
 
 
475 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 
351 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  23.71 
 
 
475 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 
366 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 
351 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 
358 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 
349 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  25.96 
 
 
331 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  25.26 
 
 
344 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  34.85 
 
 
301 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 
352 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 
358 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  24.73 
 
 
351 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  40 
 
 
332 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  24.66 
 
 
358 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 
396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  22.04 
 
 
334 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 
352 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 
352 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 
352 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  24.32 
 
 
351 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  25.58 
 
 
394 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  22.61 
 
 
355 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  40.16 
 
 
328 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 
342 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  24.12 
 
 
351 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 
413 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  24.49 
 
 
358 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 
394 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  27.45 
 
 
413 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  24.04 
 
 
344 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 
358 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  22.34 
 
 
344 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  22.85 
 
 
372 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  24.66 
 
 
358 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  25.14 
 
 
375 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  25.71 
 
 
393 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  24.26 
 
 
380 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  22.73 
 
 
354 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>