More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1013 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  100 
 
 		 394 aa  805    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  35.79 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.97 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  28.26 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  30.43 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  28.61 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 		 364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  29.55 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  29.04 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  27.71 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  32.45 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  30.37 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  29.08 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  30.27 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  31.96 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  25.83 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  31.47 
 
 		 346 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  27.87 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  26.82 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  30.26 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  29.4 
 
 		 355 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  29.73 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  31.32 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  30 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  31.5 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  27.81 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  26.3 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3489  putative secretion protein  27.53 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  35.92 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 351 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  29.9 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  24.73 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  28.94 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  27.07 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  28.54 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  30.15 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  29.37 
 
 		 343 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  28.81 
 
 		 332 aa  120  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  29.12 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  28.54 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  35.96 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  40.24 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  27.62 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  29.92 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  26.7 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  26.44 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  29.12 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  29.01 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 		 360 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  30.06 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  26.3 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  28.03 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  31.56 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.58 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  26.3 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  33.2 
 
 		 358 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 351 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  28.31 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  45.39 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  28.8 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  25.66 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  40.15 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  41.77 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  44.74 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  33.47 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  44.53 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  32.85 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  31.39 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  28.44 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  40.74 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>