More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5404 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 324 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  35.51 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  35.91 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  29.5 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  32.18 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 		 370 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  31.31 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  29.94 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  33.75 
 
 		 402 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  30.57 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  30.12 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  30.55 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  29.65 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  30 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  30.55 
 
 		 366 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  32.36 
 
 		 396 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  29.02 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  32.06 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  28.8 
 
 		 394 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  30.25 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  28.75 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  28.8 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  30.25 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  28.26 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  32.19 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  33.55 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  31.43 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 360 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  30.03 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  28.94 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  28.06 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  27.83 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  29.03 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  29.56 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  27.97 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  29.56 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  29.49 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  29.9 
 
 		 411 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  33.23 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  30.31 
 
 		 383 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  29.94 
 
 		 459 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  33.76 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  29.77 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  32.8 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  36.98 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  28.53 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  30.77 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  33.55 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 383 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  28.66 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  29.17 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 		 423 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  30.77 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  29.9 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  31.09 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  30.28 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  30.35 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  30.09 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>