More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0573 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0573  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
389 aa  790    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000216198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.9 
 
 
391 aa  249  8e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 
394 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.85 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.47 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 
407 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  25.15 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.29 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.29 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 
442 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.55 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  23.66 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  28.72 
 
 
429 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  23.62 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.39 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.67 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  25.28 
 
 
448 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  22.74 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.81 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  24.72 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  26.32 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  25.65 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  24.35 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  20.05 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.22 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  21.96 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  25.29 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 
429 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  21.28 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  29.46 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  24.57 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  20.43 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.86 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 
451 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  24.1 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.2 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  24.13 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  21.73 
 
 
421 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.4 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  29.02 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 
469 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.86 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  23.59 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  24.23 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  23.81 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  23.37 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.54 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  24.37 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  21.5 
 
 
360 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 
345 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  25.18 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.97 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  25.4 
 
 
383 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  24.22 
 
 
366 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.34 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.12 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  24.68 
 
 
368 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1474  RND family efflux transporter MFP subunit  23.48 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0567853  normal  0.0481881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  25.93 
 
 
268 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  25.29 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  29.07 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  21.61 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  28.05 
 
 
417 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  24.71 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.36 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  24.8 
 
 
366 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1615  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000338384  decreased coverage  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>