More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0259 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  100 
 
 
327 aa  650    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  46.06 
 
 
326 aa  270  2e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  33.77 
 
 
331 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  32 
 
 
328 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  32 
 
 
328 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 
332 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  33.84 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  33.84 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  33.84 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  33.84 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  33.84 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  33.56 
 
 
344 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  32.92 
 
 
342 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  32.57 
 
 
328 aa  178  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  34.08 
 
 
332 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  34.08 
 
 
332 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  34.08 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  34.08 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  34.08 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  34.08 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  34.08 
 
 
331 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  35.45 
 
 
339 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  33.76 
 
 
331 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  33.76 
 
 
331 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  31.08 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  32.09 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  32.09 
 
 
354 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  33.78 
 
 
344 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  34.14 
 
 
347 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  31.42 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  31.12 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  32.89 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  30.7 
 
 
334 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 
345 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  33.13 
 
 
345 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  30.82 
 
 
344 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  31.91 
 
 
345 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  31.83 
 
 
346 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  33.45 
 
 
334 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  33.73 
 
 
359 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  32.3 
 
 
337 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  32.54 
 
 
336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  31.46 
 
 
340 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  31.72 
 
 
337 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  32.75 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 
349 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.59 
 
 
335 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.96 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 
354 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  31.4 
 
 
339 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  29.79 
 
 
357 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  30.84 
 
 
350 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 
333 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 
320 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  27.82 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.23 
 
 
328 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  28.44 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.52 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 
377 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.99 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  27.69 
 
 
330 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 
347 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 
310 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 
365 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  25.85 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.33 
 
 
331 aa  96.3  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25.95 
 
 
517 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  27.03 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  23.73 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  23.58 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.13 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  26.47 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  25.76 
 
 
477 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  24.69 
 
 
316 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  23.49 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  23.39 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  21.52 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  25.85 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  22.96 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  23.24 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  25.83 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  23.17 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  23.82 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  23.55 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  21.29 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  22.49 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 
541 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  23.21 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  21.61 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  24.55 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  27.15 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  29.76 
 
 
541 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  24.67 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.33 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>