More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1263 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  631  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  69.02 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  66.77 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  52.73 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  50.98 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  48.51 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  50.32 
 
 		 323 aa  285  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  51.12 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  48.18 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  39.8 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  41.59 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  38.83 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  38.28 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 		 383 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 384 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  38.14 
 
 		 378 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  38.26 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1354  secretion protein HlyD family protein  41.86 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  33.58 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.34 
 
 		 335 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  32.22 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  32.22 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  31 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  33.08 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.66 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.72 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  30.58 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  32.46 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  31.48 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  32.46 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  32.84 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  32.46 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  32.46 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  32.46 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  32.84 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  32.84 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  32.84 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  32.84 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  32.84 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  32.84 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29.32 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28.34 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  31.73 
 
 		 344 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.34 
 
 		 349 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  29.56 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 354 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  27.87 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  27.87 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  27.1 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  27.1 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.39 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.47 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.41 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  30.51 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.15 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.39 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  32.96 
 
 		 346 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 354 aa  85.9  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  27.34 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  27.74 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  31.62 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  29.17 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  29.46 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  28.47 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  25.86 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  26.59 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  25.16 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  27.24 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  27.65 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  31.89 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  27.24 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.67 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  34.83 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  28.7 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  27.23 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  27.46 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  28.95 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>