More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0409 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  100 
 
 		 332 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  78.93 
 
 		 320 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  63.76 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  63.42 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  65.22 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  60.52 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  60.54 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  52.72 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  61.2 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  61.33 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  45.49 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  43.53 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  36.94 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  36.62 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  46.23 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  42.04 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  34.3 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  35.58 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  35.26 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  39.19 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  30.45 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  32.27 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  41.46 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  32.09 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  32.17 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  28.96 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  32.98 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  30.54 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  41.39 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  30.35 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  28.39 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  24.75 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.01 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.06 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  32.09 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  32.09 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  30.6 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.1 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 372 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 313 aa  95.9  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.05 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  28.04 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.37 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  28.16 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  26.92 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  29.66 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  30.1 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  29.34 
 
 		 344 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.19 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29.17 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  27.97 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  23.6 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  30.51 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.89 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.21 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  30.98 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30.66 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  27.3 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  30.07 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  21.33 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  30.45 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  25.08 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  28.92 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  25.39 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  22.37 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  30.58 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  27.68 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  29.15 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  23.88 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  32.41 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  27.17 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  30.17 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  27.45 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  30.17 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  30.17 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  30.17 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  30.17 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  28.12 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>