More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4164 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
320 aa  630  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  97.5 
 
 
320 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  90.03 
 
 
321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  69.23 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  61.54 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  61.54 
 
 
324 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  61.07 
 
 
320 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  61.33 
 
 
311 aa  315  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  61.33 
 
 
332 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  52.23 
 
 
315 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  48.06 
 
 
356 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  46.39 
 
 
326 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  40.65 
 
 
359 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  37.81 
 
 
326 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  37.5 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  42.76 
 
 
344 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 
314 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  39.94 
 
 
314 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  39.62 
 
 
314 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  34.82 
 
 
317 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  40.68 
 
 
324 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 
328 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  44.6 
 
 
328 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  34.4 
 
 
317 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  32.81 
 
 
258 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  31.63 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  41.31 
 
 
313 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  31.67 
 
 
263 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  31.89 
 
 
257 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  31.1 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  44.27 
 
 
265 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  41.44 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.89 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29.01 
 
 
328 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.78 
 
 
354 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  29.97 
 
 
357 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  31.35 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.07 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.05 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.05 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.31 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 
368 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.37 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  28.77 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  24.55 
 
 
349 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  31.19 
 
 
467 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 
333 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  27.54 
 
 
308 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  30.23 
 
 
382 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  30.39 
 
 
363 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.77 
 
 
342 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  30 
 
 
357 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  28.42 
 
 
357 aa  89.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 
357 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  24.5 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.05 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  28.96 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  29.93 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  31.27 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.18 
 
 
331 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  28.62 
 
 
331 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  28.62 
 
 
331 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
344 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  21.28 
 
 
331 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  28.67 
 
 
358 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 
383 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  27.18 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  30.1 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  28.43 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  29.63 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  24.3 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  28.86 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  27.49 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.71 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  28.23 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  28.42 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  24.57 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.8 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  25.33 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  30.13 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  28.67 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  29.58 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  29.05 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>