More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0700 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  100 
 
 		 359 aa  718    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  45.95 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  45.81 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  42.9 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  42.12 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  42.9 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  44.98 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  44.84 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  43.73 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  36.94 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  42.31 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  36.42 
 
 		 332 aa  203  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  41.5 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  43.37 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  43.04 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  41.88 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  35.53 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  39.41 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  32.89 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  32.79 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.81 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  39.31 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  29.69 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  28.53 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  27.22 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  28.4 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  40.82 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.49 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  27.12 
 
 		 257 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  27.61 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  30.66 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.46 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.46 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  31.02 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  39.93 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.35 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  31.73 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.72 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  30.63 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.6 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  26.64 
 
 		 322 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  31.39 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  26 
 
 		 350 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.63 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.64 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.92 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  26.58 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  30.82 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.76 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  26.87 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.74 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  25.8 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  32.47 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  27.14 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  28.92 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  26.94 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  26.94 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.16 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  22.29 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  31.32 
 
 		 363 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  28.63 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  26.97 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  27.16 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  27.72 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  28.28 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  31.09 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  28.74 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  27.86 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  27.86 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  27.86 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  27.96 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  27.86 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  27.82 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.23 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.94 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  27.86 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  26.89 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  24.83 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>