More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0052 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  98.46 
 
 		 324 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 324 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  86.67 
 
 		 311 aa  474  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  63.21 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  62.29 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  58.1 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  59.27 
 
 		 321 aa  318  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  53.59 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  61.87 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  61.33 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  49.48 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  45.95 
 
 		 359 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  46.03 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  38.94 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  38.61 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  44.77 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  37.26 
 
 		 317 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  41.72 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  37.15 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  36.81 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  41.36 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  34.33 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  35.36 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  32.56 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  33.01 
 
 		 266 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  40.21 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  31.65 
 
 		 263 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  40.39 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.15 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  32.38 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.83 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.53 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 355 aa  99.4  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.2 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  33.56 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  29.79 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.58 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.16 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  23.78 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.39 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.39 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  28.38 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  32 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  30.07 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  31.64 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  30.61 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.49 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.76 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  28.77 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.9 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  29.62 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  29.62 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  29.62 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  29.62 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.62 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  29.62 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  28.26 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  30.07 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  27.93 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  29.04 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.9 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  29.47 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  29.61 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  26.64 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  27.05 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  27.24 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  23.68 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.43 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  30.43 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  25.6 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  28.41 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  26.64 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>