More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1035 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  100 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  45.54 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  40.69 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  42.42 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  34.71 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  42.86 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  34.02 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  43.96 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  36.71 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  39.93 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  41.39 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  38.51 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  39.12 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  36.93 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  39.19 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  38.7 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  37.82 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  32.91 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  31.16 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  29.76 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  29.84 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  29.62 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  28.77 
 
 		 267 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  29.21 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  34.19 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  30.1 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.56 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  31.4 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  39.19 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  35.27 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  31.43 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  31.46 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  31.43 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  32.07 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  31.43 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  29.76 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  31.1 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  29.69 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  29.66 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  30.69 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  39.19 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  31.52 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  30.59 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  32.72 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.02 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.02 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  25.26 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  30.85 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  31.06 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  31.87 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.36 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  27.91 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  31.51 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0737  hypothetical protein  34.78 
 
 		 190 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  27.52 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  31.33 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  28.72 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  30.95 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  29.81 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.59 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  22.22 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.14 
 
 		 331 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  25.55 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  28.23 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  26.61 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  26.86 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  25.63 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  28.95 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  27.64 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  26.55 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  27.58 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  23.03 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  33.79 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  30.4 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  28.36 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  19.57 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>