More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1925 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 328 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  34.37 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  29.73 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  31.49 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  30.87 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  32.58 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  32.26 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  32.26 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  31.94 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  28.75 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  32.37 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  31.94 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  31.61 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  31.61 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  31.06 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  30.09 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  29.15 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  31.31 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  29.38 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  33.45 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  28.21 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  28.16 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  29.15 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  28.16 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  26.77 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  29.31 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.92 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  27.06 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  24.54 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  23.21 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.58 
 
 		 342 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  25.5 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  24.33 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  24.33 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  24.58 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  23.95 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  23.95 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  23.95 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  25.6 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  25.6 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  24.71 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.34 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  26.64 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  26.87 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  24.69 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.85 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  26.91 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  23.8 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  22.05 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  22.05 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  22.05 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  22.05 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  22.05 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.53 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.53 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  22.05 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  22.05 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  22.05 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  26.55 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.33 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  26.12 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  25.87 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  21.67 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  28.19 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  27.46 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.33 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  26.54 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  24.73 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  27.55 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  24.15 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  22.82 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>