More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4571 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 349 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  48.01 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  47.08 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  47.98 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  48.29 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  47.81 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  47.17 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  46.23 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  46.84 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  46.84 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  46.52 
 
 		 324 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  46.2 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  46.52 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  46.2 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  46.2 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  48.55 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  44.79 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  44.94 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  46.03 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  43.13 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  46.42 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  47.81 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  41.69 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  44.9 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  49.65 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  42.95 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  44.37 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  39.5 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  40.14 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  40.89 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  40.55 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  35.96 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  36.28 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  33.86 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  33.97 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  31.94 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  26.88 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  30.21 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.06 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  27.87 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 462 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  26.49 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.62 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  20.99 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  32.62 
 
 		 366 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  24.6 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  32.43 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  32.09 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  28.84 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.68 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.68 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  33.44 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28.84 
 
 		 343 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.84 
 
 		 343 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.84 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.47 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  28.46 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  28.84 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  32.27 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.84 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.84 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  32.09 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  32.09 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.19 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  29.1 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  24.59 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  28.46 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  30.82 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.87 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  29.78 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  27.76 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  31.15 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  26.18 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  31.08 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  27.14 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  27.14 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  31.93 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  30.6 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.64 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  27.15 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  25.98 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  24.52 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  27.84 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  28.94 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  30.68 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>