More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2777 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
323 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  99.07 
 
 
323 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  97.83 
 
 
323 aa  587  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  39.62 
 
 
326 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  38.17 
 
 
323 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  38.79 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  38.89 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  38.56 
 
 
324 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 
324 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  40.28 
 
 
326 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 
324 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 
324 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 
324 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 
324 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  40.34 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  38.59 
 
 
322 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 
329 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 
323 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  35.79 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  37.11 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  39.55 
 
 
331 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  38.28 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  38.97 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  37.37 
 
 
326 aa  179  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 
326 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 
323 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  37.04 
 
 
332 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  37.67 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 
330 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  29.78 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  40.55 
 
 
349 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 
337 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 
323 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  36.24 
 
 
330 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  35.64 
 
 
367 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 
353 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  31.12 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.47 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  33.22 
 
 
333 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.37 
 
 
462 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.92 
 
 
329 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.13 
 
 
335 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
398 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  28.44 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.93 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  31.44 
 
 
344 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.08 
 
 
395 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  29.43 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  24.04 
 
 
328 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.83 
 
 
400 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  29.8 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  32.54 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.43 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.75 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.18 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.32 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.39 
 
 
354 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  26.4 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.67 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.42 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 
414 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  25.23 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  30.66 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  25.25 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  30.31 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  28.86 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.2 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  28.12 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.49 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  23.98 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  27.53 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.62 
 
 
420 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  27.7 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  29.45 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  29.45 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  24.19 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  29.45 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  29.77 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  31.53 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  30.37 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.53 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.53 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.45 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.9 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  30.34 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  26.75 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>