More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2703 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 367 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  46.73 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  37.46 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  36.51 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  32.59 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  36.08 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  36.22 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  36.08 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  36.08 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  31.6 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  35.9 
 
 		 324 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  32.4 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  33.54 
 
 		 331 aa  165  9e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  35.95 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  31.53 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  35.64 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  35.64 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  34.19 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  35.96 
 
 		 322 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  34.94 
 
 		 323 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  35.87 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  34.22 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  32.8 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  31.15 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  32 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  30.97 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  35.27 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  35.51 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  26.3 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 444 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  27.42 
 
 		 463 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  25.22 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 352 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  26.52 
 
 		 467 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  28.79 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  25.44 
 
 		 335 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  25.78 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23.74 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.62 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  29.01 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.56 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  29.19 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  27.56 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  27.8 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  27.42 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  30.5 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  23.44 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  23.76 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.49 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25.87 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  29.74 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  27.44 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  23.37 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  25.89 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 504 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  30.03 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  23.9 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  25.77 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  25.46 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  26.74 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  23.08 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  24.41 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  30.6 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  30.66 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.66 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  26.55 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.18 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  29.18 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  29.18 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>