More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2446 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  100 
 
 		 331 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  50.61 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  38.19 
 
 		 335 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  37.33 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  34.01 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  35.17 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  32.11 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  35.27 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.31 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.31 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.79 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.81 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.43 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.83 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  28.2 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  28.2 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  28.2 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  28.2 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  28.2 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  29.31 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  29.47 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  29.47 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  29.47 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  30.28 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  28.79 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  28.79 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  30.22 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  29.64 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  29.47 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  31.42 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  29.7 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  28.04 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  28.72 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.38 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  30.41 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  29.93 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 541 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  26.15 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.27 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  38.26 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.42 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.42 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  26.41 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  28.14 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.37 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.93 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  29.07 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  26.93 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  28.81 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5637  hypothetical protein  28.01 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  26.35 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  28.41 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  27.85 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  27.36 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 504 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  35.66 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 345 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  22.28 
 
 		 425 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 315 aa  95.9  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  24.3 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.64 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  25.23 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  29.31 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  24.3 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  24.48 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  27.36 
 
 		 372 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  27.52 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  24.82 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  29.55 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>