More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1840 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  66.98 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  65.84 
 
 		 324 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  65.81 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  66.04 
 
 		 326 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  56.75 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  57.19 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  56.87 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  56.87 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  57.45 
 
 		 332 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  55.38 
 
 		 324 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  55.06 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  55.06 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  56.05 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  56.09 
 
 		 324 aa  355  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  56.05 
 
 		 324 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  54.75 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  55.73 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  57.32 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  54.49 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  56.23 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  54.52 
 
 		 322 aa  332  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  40.47 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  43.05 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  37.69 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  40.07 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  38.36 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  30.7 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  30.06 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  31.15 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  31.12 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.56 
 
 		 462 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.11 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  25.33 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  25.39 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  27.09 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  24.1 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  28.17 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  24.91 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.38 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  26.03 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  24.48 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  22.73 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  25.9 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  22.38 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  26.32 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  25.5 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  27.1 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  25.89 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  24.11 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  24.01 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  25.16 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  21.35 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  23.32 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  25 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  24.02 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  27.17 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.71 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  23.97 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  22.87 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  27.21 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  23.97 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  24.6 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  27.21 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  25.26 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  27.03 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>