More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3445 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 359 aa  706    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  71.79 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  63.87 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  64.77 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  66.97 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  67.14 
 
 		 355 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  68.15 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  68.15 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  68.15 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  67.86 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  69.88 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  62.54 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  63.38 
 
 		 357 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  60.54 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  67.17 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  67.17 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  60.48 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  59.1 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  59.04 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  54.96 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  55.52 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  55.14 
 
 		 382 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.46 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  55.17 
 
 		 355 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  55.17 
 
 		 355 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  55.17 
 
 		 355 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  55.17 
 
 		 355 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  54.89 
 
 		 355 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  55.17 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  58.41 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  56.41 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  56.85 
 
 		 352 aa  352  7e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  55.45 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  57.54 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  56.98 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.98 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  56.32 
 
 		 358 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  56.98 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.98 
 
 		 355 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  58.96 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  57.34 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  57.34 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  58.79 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  57.88 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  58.28 
 
 		 358 aa  331  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  57.06 
 
 		 389 aa  328  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  54.09 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  50.16 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  47.28 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  52.12 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  70.81 
 
 		 161 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  42.57 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  43.93 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  41.02 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  42.68 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  41.45 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  43.59 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  40.5 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  41.29 
 
 		 341 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  41.88 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  40.18 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  41.67 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  42.86 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  42.69 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  41.64 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  38.02 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  45.09 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  45.09 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  65.69 
 
 		 195 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  36.67 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  36.02 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.78 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  32.19 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.73 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.73 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  31.46 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.16 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  24.64 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  30.56 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  33.03 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.62 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.18 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.39 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  29.24 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  31.43 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  31.48 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.49 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>