More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0760 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 363 aa  714    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  73.95 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  64.96 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  67.05 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  64.67 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  66.17 
 
 		 357 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  66.17 
 
 		 357 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  66.17 
 
 		 357 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  66.17 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  64.86 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  63.03 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  61.03 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  68.48 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  68.48 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  61.38 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  61.08 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  63.74 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  58.19 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  63.45 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  58.36 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  56.97 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  57.23 
 
 		 355 aa  360  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  55.09 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  55.36 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  55.36 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  55.36 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  55.36 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  55.07 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.36 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  55.36 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  57.93 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  55.74 
 
 		 355 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  55.4 
 
 		 352 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.44 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  56.02 
 
 		 355 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  56.02 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.02 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.02 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  58.05 
 
 		 356 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  55.59 
 
 		 356 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  57.45 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  56.67 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  58.43 
 
 		 358 aa  332  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  55.16 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  55 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  53.07 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  55.29 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  50.48 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  47.34 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  45.78 
 
 		 343 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  46.73 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  43.44 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  42.04 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  73.42 
 
 		 161 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  44.24 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 343 aa  239  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  42.94 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  42.5 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  42.94 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  40.23 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  40.71 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  43.87 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  40.25 
 
 		 346 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  42.98 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  42.77 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  46.18 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  46.18 
 
 		 319 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  42.68 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  42.68 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  35.1 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  41.74 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  60.43 
 
 		 195 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.6 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  44.68 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.23 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 		 329 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  31.74 
 
 		 321 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  26.4 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.82 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.89 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.87 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  33.23 
 
 		 331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  36.04 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.63 
 
 		 328 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.44 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.44 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  28.75 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.4 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.77 
 
 		 335 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>