More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0748 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 343 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  48.52 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  48.22 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  47.92 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  48.72 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  47.58 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  50.5 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  46.95 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  45.73 
 
 		 351 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  43.53 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  43.33 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  46.67 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  46.67 
 
 		 355 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  46.67 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  46.67 
 
 		 355 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  46.67 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  46.67 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  45.65 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  46.11 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  50.34 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  46.67 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  43.6 
 
 		 356 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  47.71 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  47.26 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  48.15 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  45.79 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  46.53 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  45.62 
 
 		 467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  44.51 
 
 		 358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  46.73 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  44.65 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  46.74 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  46.06 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  45.37 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  46.89 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  47.24 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  46.06 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  46.06 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  46.06 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  47.13 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  46.58 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  46.58 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  49.32 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  46.58 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  47.52 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  43.93 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  51.84 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  42.55 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  43.54 
 
 		 346 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  43.33 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  43.2 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  43.61 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  45.71 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  43.62 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  44.61 
 
 		 391 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  46.25 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  45.57 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  45.57 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  44.28 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  41.46 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  45.93 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  45.93 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  43.17 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  42.23 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  48.32 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  48.32 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  42.21 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  47.99 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  40.71 
 
 		 350 aa  212  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  43 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  57.76 
 
 		 161 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  38.29 
 
 		 284 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  32.66 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.08 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.44 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  31.27 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.88 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.77 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.88 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  30.71 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  25.48 
 
 		 281 aa  92.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.18 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  30.55 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  30.55 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  29.82 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  29.35 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.1 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  28.03 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  32.14 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.86 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>