More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1152 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
355 aa  692    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  58.31 
 
 
354 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  56.07 
 
 
382 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  55.2 
 
 
357 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  54.18 
 
 
355 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  54.22 
 
 
357 aa  338  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  55.89 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  54.13 
 
 
356 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  53.33 
 
 
358 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  53.22 
 
 
467 aa  328  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  53.5 
 
 
358 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  54.38 
 
 
357 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  56.07 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  54.89 
 
 
357 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  52.57 
 
 
357 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  50.28 
 
 
355 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  55.83 
 
 
363 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  52.02 
 
 
355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
355 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  50 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  50 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  50 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  50 
 
 
355 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  53.47 
 
 
356 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  53.64 
 
 
355 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  52.31 
 
 
355 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  52.31 
 
 
355 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  55.62 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  52.31 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  52.02 
 
 
355 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  52.06 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  53.71 
 
 
357 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  53.71 
 
 
357 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  53.71 
 
 
357 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  53.71 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  56.71 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  56.71 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  51.97 
 
 
356 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  54.29 
 
 
358 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  51.96 
 
 
356 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  50 
 
 
355 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  50.29 
 
 
355 aa  293  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  50.29 
 
 
391 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  52.42 
 
 
357 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  50.76 
 
 
389 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  50.77 
 
 
350 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  52.38 
 
 
356 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  42.65 
 
 
365 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  48.01 
 
 
429 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 
332 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  43.61 
 
 
350 aa  232  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 
351 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  44.03 
 
 
331 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 
343 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 
343 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 
348 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  36.9 
 
 
346 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  39.24 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  41.29 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  40.98 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 
341 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  61.88 
 
 
161 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  41.69 
 
 
321 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  43.26 
 
 
332 aa  205  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  38.46 
 
 
356 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  39.2 
 
 
328 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  41.77 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  42.19 
 
 
331 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 
437 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 
319 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  41.85 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  41.85 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  41.96 
 
 
331 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  38.83 
 
 
332 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  33.13 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  28.36 
 
 
425 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  35.19 
 
 
333 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  42.64 
 
 
284 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  35.28 
 
 
333 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.61 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.53 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.89 
 
 
335 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  31.53 
 
 
395 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.57 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  33.11 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  46.76 
 
 
195 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  32.03 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.55 
 
 
328 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.41 
 
 
354 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.55 
 
 
328 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.8 
 
 
331 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  27.33 
 
 
326 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  27.33 
 
 
332 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.4 
 
 
342 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  31.48 
 
 
321 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>