More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5441 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  100 
 
 		 321 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  77.63 
 
 		 319 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  77.29 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  77.29 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  51.84 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  43.43 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  45.28 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  41.85 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 356 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  47.49 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  43.94 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  42.11 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  41.72 
 
 		 467 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  43.75 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  43.6 
 
 		 354 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  42.64 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  41.55 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  43.77 
 
 		 356 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  42.24 
 
 		 334 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  45.06 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  41.21 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  41.69 
 
 		 358 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 357 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  44.95 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  41.53 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  42.12 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  42.12 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  42.12 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  42.12 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  43.03 
 
 		 355 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  41.71 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  43.25 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  41.71 
 
 		 391 aa  225  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  44.37 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  41.95 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  41.76 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  43.5 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  43.5 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  43.5 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  45.31 
 
 		 355 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  41.85 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  43.2 
 
 		 357 aa  221  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  42.24 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.24 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  43.12 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.24 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  43.77 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  43.87 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  42.02 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  42.25 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  44.69 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  45.86 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  45.05 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  41.54 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  41.33 
 
 		 437 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  40.71 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  40.85 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  44.15 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  41.91 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  41.38 
 
 		 350 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  37.92 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  42.76 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  42.76 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  52.26 
 
 		 161 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.48 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.29 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  32.99 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  32.99 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 		 425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  32.24 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  32.13 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  27.99 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.93 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  31.6 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  28.75 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  28.75 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  27.67 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  33.21 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  27.87 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  30.54 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  30.37 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.76 
 
 		 344 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>