More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1310 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  99.38 
 
 
357 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  99.38 
 
 
357 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  99.38 
 
 
357 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  323  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  96.71 
 
 
357 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  81.76 
 
 
357 aa  275  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  78.26 
 
 
356 aa  269  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  80.92 
 
 
357 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  80.92 
 
 
357 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  75.62 
 
 
355 aa  256  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  70.81 
 
 
359 aa  247  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  71.7 
 
 
467 aa  246  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  73.42 
 
 
363 aa  244  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  69.57 
 
 
357 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  71.7 
 
 
354 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  73.08 
 
 
356 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  68.94 
 
 
382 aa  239  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  71.61 
 
 
356 aa  238  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  71.7 
 
 
355 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  71.7 
 
 
355 aa  237  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  71.7 
 
 
355 aa  237  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  71.7 
 
 
355 aa  237  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  71.7 
 
 
355 aa  237  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  71.7 
 
 
355 aa  237  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  71.7 
 
 
355 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  71.7 
 
 
355 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  67.92 
 
 
357 aa  235  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  67.3 
 
 
357 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  68.94 
 
 
352 aa  231  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  67.5 
 
 
358 aa  230  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  67.3 
 
 
358 aa  228  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  69.93 
 
 
355 aa  228  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  68.55 
 
 
355 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  68.55 
 
 
355 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  68.55 
 
 
355 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  68.55 
 
 
355 aa  226  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  67.92 
 
 
355 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  67.92 
 
 
357 aa  224  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  74.51 
 
 
356 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  74.51 
 
 
356 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  66.89 
 
 
356 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  68.28 
 
 
389 aa  212  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  65.54 
 
 
356 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  71.13 
 
 
355 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  69.66 
 
 
356 aa  209  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  71.13 
 
 
391 aa  208  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  64.71 
 
 
358 aa  206  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  65.25 
 
 
429 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  58.39 
 
 
332 aa  199  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  57.72 
 
 
350 aa  199  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  58.44 
 
 
343 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  57.42 
 
 
365 aa  183  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  56.58 
 
 
332 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  56.21 
 
 
331 aa  180  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  52.56 
 
 
351 aa  177  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  53.16 
 
 
348 aa  175  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  53.8 
 
 
343 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  53.8 
 
 
343 aa  174  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  53.8 
 
 
339 aa  174  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  53.8 
 
 
350 aa  173  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  52.63 
 
 
321 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  49.7 
 
 
346 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  62.25 
 
 
355 aa  167  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  54.86 
 
 
328 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  51.61 
 
 
334 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  54.79 
 
 
437 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  51.22 
 
 
341 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  51.83 
 
 
341 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  50 
 
 
331 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  49.01 
 
 
332 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  52.74 
 
 
331 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  52.74 
 
 
331 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  53.15 
 
 
321 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  49.69 
 
 
356 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  71.91 
 
 
284 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
319 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
319 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  37.75 
 
 
321 aa  97.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  33.1 
 
 
371 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  35.46 
 
 
329 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 
333 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  41.53 
 
 
355 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  40.71 
 
 
333 aa  87.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  34.25 
 
 
329 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
335 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  34.65 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  36.44 
 
 
345 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 
345 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  36.97 
 
 
330 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  38.46 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  32.48 
 
 
368 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3111  secretion protein HlyD  38.53 
 
 
346 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3305  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 
332 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  38.14 
 
 
477 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  34.17 
 
 
328 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  33.9 
 
 
328 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  34.71 
 
 
331 aa  74.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  30.34 
 
 
425 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>