More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3661 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 389 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  74.63 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  68.1 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  68.36 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  71.55 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  72.54 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  64.37 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  64.66 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  61.79 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  63.02 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  59.94 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  58.9 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  55.59 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  56.06 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  56.94 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  55.81 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  54.94 
 
 		 357 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  52.2 
 
 		 467 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  55.75 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  56.53 
 
 		 359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  53.16 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  55.59 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  62.61 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  57.7 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  57.7 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  53.19 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  54.29 
 
 		 356 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  54.35 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  54.35 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  56.75 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  51.16 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  54.35 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  52.24 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  51.16 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  51.16 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  54.35 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  51.16 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  50.87 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  51.16 
 
 		 355 aa  332  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  53.29 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  56.5 
 
 		 357 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  56.5 
 
 		 357 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  56.5 
 
 		 357 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  52.52 
 
 		 357 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  56.19 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  52.68 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  54.29 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  43.49 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  44.57 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  50 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  50.44 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  47.13 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  44.09 
 
 		 437 aa  255  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  45.09 
 
 		 332 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  44.27 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  40.34 
 
 		 334 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  42.14 
 
 		 341 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 346 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  43.83 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  41.8 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  43.83 
 
 		 343 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  43.53 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 350 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  40.61 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  41.69 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  40.24 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  43.87 
 
 		 332 aa  223  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 319 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  43.43 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  42.22 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  38.81 
 
 		 284 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  40 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 332 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  30 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.1 
 
 		 335 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 		 329 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  47.1 
 
 		 195 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  30.69 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  24.36 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.87 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.31 
 
 		 332 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.55 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  30.98 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.97 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.17 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.93 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  27.71 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25.99 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  30.06 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>