More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5975 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  95.52 
 
 		 357 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  75.9 
 
 		 354 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  68.48 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  60.67 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  58.54 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  61.68 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  62.96 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  59.15 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  60.93 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  57.51 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  56.86 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  56.86 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  57.85 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  56.86 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  56.86 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  56.86 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  56.86 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  60.24 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  58.02 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  62.65 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  62.65 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  62.65 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  60.18 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  58.23 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  58.31 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  58.31 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  62.65 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  57.98 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  58.31 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  58.31 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  59.09 
 
 		 356 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  59.27 
 
 		 355 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  58.54 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  59.82 
 
 		 363 aa  358  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  56.33 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  59.25 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  55.89 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  57.31 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  58.05 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  59.04 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  59.45 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  55.32 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  57.19 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  60.12 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  60.12 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  56.07 
 
 		 355 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  53.52 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  53.85 
 
 		 350 aa  299  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  47.8 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  53.44 
 
 		 332 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  48.32 
 
 		 350 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  47.4 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  46.73 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  47.09 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  45.17 
 
 		 339 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  44.27 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  44.58 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  41.04 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  68.94 
 
 		 161 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  42.11 
 
 		 321 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  39.66 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  42.29 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  43.49 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  43.77 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  41.38 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  41.92 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  45.62 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  42.86 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  45.31 
 
 		 319 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  41.61 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 		 331 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  38.82 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  49 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  33.13 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 329 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  32.99 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  55.64 
 
 		 195 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  29.84 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  33.11 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  31 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.01 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.75 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  28.26 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  34.45 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  33.9 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  32.39 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  29.81 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  32.86 
 
 		 339 aa  117  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.9 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  35.09 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.9 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  28.76 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>