More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3835 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  98.87 
 
 		 355 aa  694    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  98.59 
 
 		 355 aa  693    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  98.59 
 
 		 355 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  98.87 
 
 		 355 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  98.59 
 
 		 355 aa  694    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  98.87 
 
 		 355 aa  694    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  100 
 
 		 355 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  98.59 
 
 		 355 aa  691    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  86.48 
 
 		 355 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  87.32 
 
 		 355 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  87.04 
 
 		 355 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  87.04 
 
 		 355 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  86.76 
 
 		 355 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  57.22 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  57.06 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  60 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  61.31 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  56.21 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  57.36 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  59.01 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  59.47 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  59.47 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  59.47 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  59.76 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  55.81 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  54.91 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  56.46 
 
 		 357 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  59.2 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  54.55 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  54.81 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  56.44 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  59.04 
 
 		 356 aa  339  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  54.78 
 
 		 357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  55.89 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  54.52 
 
 		 355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  97.46 
 
 		 284 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  54.52 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  57.45 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  53.47 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  55.12 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  54.05 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  54.65 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  55.25 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  55.56 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  52.76 
 
 		 389 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  54.23 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  55.96 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  55.96 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 355 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  51.3 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  46.81 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  42.05 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  42.78 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  43.83 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  41.49 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  44.82 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  70.81 
 
 		 161 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  44.38 
 
 		 348 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  41.05 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  42.44 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  40.95 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  43.81 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  41.99 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  42.56 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  41.62 
 
 		 341 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  42.26 
 
 		 321 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  43.3 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  43.61 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  35.98 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 321 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  33 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.43 
 
 		 329 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.79 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.85 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  48.92 
 
 		 195 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  29.49 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  31.33 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  31.33 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  32.98 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  36.33 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.16 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  32.64 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  27.74 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  29.78 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>