More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2360 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
356 aa  697    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
356 aa  697    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  66.76 
 
 
467 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  67.38 
 
 
359 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  66.56 
 
 
356 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  70.48 
 
 
363 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  60.81 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  67.79 
 
 
356 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  64.86 
 
 
355 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  66.14 
 
 
356 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  62 
 
 
357 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  61.56 
 
 
357 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  62.46 
 
 
357 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  66.16 
 
 
357 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  65.85 
 
 
357 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  65.85 
 
 
357 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  65.85 
 
 
357 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  61.04 
 
 
354 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  57.63 
 
 
355 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  57.23 
 
 
358 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  60.4 
 
 
357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  59.24 
 
 
352 aa  358  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  58.21 
 
 
357 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  58.67 
 
 
382 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  56.13 
 
 
358 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  55.76 
 
 
357 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  58.43 
 
 
356 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  57.49 
 
 
389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  61.2 
 
 
358 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  55.37 
 
 
355 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  56.4 
 
 
355 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  57.1 
 
 
356 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  57.36 
 
 
356 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  55.37 
 
 
391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  55.49 
 
 
355 aa  325  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  55.49 
 
 
355 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  55.49 
 
 
355 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  55.49 
 
 
355 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  55.19 
 
 
355 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.49 
 
 
355 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  55.49 
 
 
355 aa  325  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  57.46 
 
 
355 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  56.69 
 
 
355 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  56.69 
 
 
355 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.69 
 
 
355 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.69 
 
 
355 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  49.38 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  54.42 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  52.85 
 
 
429 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  47.25 
 
 
332 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  47.47 
 
 
350 aa  252  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 
351 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  74.51 
 
 
161 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  47.47 
 
 
343 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  42.81 
 
 
321 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  43.85 
 
 
331 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  43.48 
 
 
321 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  44.16 
 
 
348 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  44.76 
 
 
343 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 
343 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  45.08 
 
 
339 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  43.8 
 
 
437 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  42.55 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  38.53 
 
 
346 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  41.11 
 
 
341 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  43.64 
 
 
328 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  43.87 
 
 
332 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  39.94 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  40.9 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  45.26 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  45.26 
 
 
319 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  45.26 
 
 
319 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 
331 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  40.62 
 
 
331 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  40.44 
 
 
331 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  38.66 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  57.78 
 
 
195 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.36 
 
 
335 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  33.54 
 
 
328 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  33.54 
 
 
328 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  34.33 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.07 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  30.82 
 
 
321 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  64.29 
 
 
284 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  34.66 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.68 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 
355 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.83 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.66 
 
 
425 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.17 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  32.54 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  33.55 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  31.75 
 
 
342 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.42 
 
 
328 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.14 
 
 
344 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  29.9 
 
 
331 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  32.86 
 
 
331 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  29.43 
 
 
371 aa  105  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>