More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0171 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  100 
 
 
356 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  87.36 
 
 
356 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  78.22 
 
 
358 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  72.03 
 
 
355 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  70.06 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  70.34 
 
 
391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  76.14 
 
 
356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  72.59 
 
 
389 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  62.69 
 
 
357 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  60.84 
 
 
357 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  64.12 
 
 
352 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  59.57 
 
 
356 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  58.43 
 
 
354 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  57.8 
 
 
357 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  58.26 
 
 
357 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  58.09 
 
 
382 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  56.37 
 
 
467 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  58.79 
 
 
359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  56.8 
 
 
356 aa  352  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  55.45 
 
 
358 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  54.76 
 
 
355 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  58.62 
 
 
355 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  53.71 
 
 
355 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  55.33 
 
 
355 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  53.71 
 
 
355 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  53.71 
 
 
355 aa  345  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  53.71 
 
 
355 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  54 
 
 
355 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  53.71 
 
 
355 aa  345  7e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  57.06 
 
 
357 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.33 
 
 
355 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  55.33 
 
 
355 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.33 
 
 
355 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  53.91 
 
 
355 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  59.18 
 
 
356 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.38 
 
 
355 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  61.54 
 
 
429 aa  338  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  56.75 
 
 
363 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  58.31 
 
 
357 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  58.31 
 
 
357 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  58.31 
 
 
357 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  58.31 
 
 
357 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  54.85 
 
 
358 aa  328  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  57.74 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  57.74 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  54.12 
 
 
357 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  54.68 
 
 
357 aa  315  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  54.14 
 
 
350 aa  302  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 
365 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  44.38 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 
351 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  47.99 
 
 
332 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  45.16 
 
 
341 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  45.35 
 
 
331 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  47.85 
 
 
343 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  44.58 
 
 
321 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 
355 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 
341 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  44.72 
 
 
339 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 
343 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 
343 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 
350 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  43.81 
 
 
348 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  42.11 
 
 
328 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  41.92 
 
 
356 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  40.62 
 
 
321 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  42.94 
 
 
437 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  43.33 
 
 
332 aa  222  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  37.86 
 
 
334 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  65.41 
 
 
161 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  45.09 
 
 
319 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 
319 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  44.17 
 
 
319 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  39.14 
 
 
284 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 
331 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  40.75 
 
 
331 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  40.12 
 
 
331 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  37.75 
 
 
332 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.75 
 
 
329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  30.93 
 
 
321 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.33 
 
 
335 aa  133  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  29.16 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  30.5 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 
368 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  32.29 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  50.72 
 
 
195 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  29.68 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.6 
 
 
335 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.74 
 
 
334 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.38 
 
 
326 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
355 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.41 
 
 
328 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.41 
 
 
328 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  31.54 
 
 
347 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.21 
 
 
331 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25.73 
 
 
332 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.58 
 
 
395 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>