More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0628 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
352 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  69.44 
 
 
357 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  66.57 
 
 
355 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  61.36 
 
 
355 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  63.17 
 
 
356 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  60.73 
 
 
354 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  59.94 
 
 
357 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  64.78 
 
 
358 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  61.82 
 
 
358 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  68.6 
 
 
356 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  61.65 
 
 
355 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  61.65 
 
 
355 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  61.65 
 
 
355 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  60.54 
 
 
357 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  61.65 
 
 
355 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  60.52 
 
 
382 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  60.76 
 
 
355 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  60.76 
 
 
355 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  60.76 
 
 
355 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  64.52 
 
 
355 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  61.05 
 
 
355 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  60.76 
 
 
355 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  60.76 
 
 
355 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  65.85 
 
 
356 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  65.45 
 
 
391 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  61.86 
 
 
355 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  61.89 
 
 
355 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  64.81 
 
 
389 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  64.18 
 
 
356 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  56.85 
 
 
467 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  61.45 
 
 
357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  60.65 
 
 
357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  60.65 
 
 
357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  57.61 
 
 
359 aa  352  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  60.65 
 
 
357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  60.36 
 
 
357 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  59.82 
 
 
358 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  56.12 
 
 
357 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  60 
 
 
356 aa  348  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  57.35 
 
 
355 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  60.61 
 
 
356 aa  344  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  60.61 
 
 
356 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  56.5 
 
 
356 aa  342  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  52.65 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  57.32 
 
 
363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  55.59 
 
 
357 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  60.12 
 
 
429 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  51.64 
 
 
350 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  52.06 
 
 
355 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  49.56 
 
 
332 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  45.86 
 
 
365 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  43.88 
 
 
351 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  42.7 
 
 
343 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  45.92 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  47.69 
 
 
343 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  47.69 
 
 
343 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  48 
 
 
339 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  44.31 
 
 
350 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  43.48 
 
 
341 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  44.09 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  44.75 
 
 
348 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  42.69 
 
 
346 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  42.94 
 
 
321 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  45.53 
 
 
284 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  40.65 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  43.8 
 
 
437 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  68.94 
 
 
161 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 
332 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  42.12 
 
 
334 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  43.61 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  41.84 
 
 
321 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  43.64 
 
 
319 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  43.47 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  43.47 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  39.56 
 
 
331 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  40.5 
 
 
331 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  36.63 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  33.63 
 
 
321 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  53.24 
 
 
195 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.44 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.26 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.7 
 
 
368 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 
320 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  31.58 
 
 
328 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  31.58 
 
 
328 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  31.34 
 
 
359 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  31.38 
 
 
334 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  34.05 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  32.88 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.01 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30.13 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.49 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.99 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  29.32 
 
 
328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  33.88 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  30.49 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  30.49 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  30.49 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  30.49 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>