More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0129 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  65.92 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  65.16 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  65.57 
 
 		 337 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  59.39 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  47.89 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  47.89 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  49.39 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  51.02 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  48.73 
 
 		 339 aa  272  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  46.88 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  50.69 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  47.12 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  48.25 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  48.25 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  48.25 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  48.25 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  48.25 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  48.25 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  48.25 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  48.25 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  47.32 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  47.32 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  47.32 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  47.32 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  47.32 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  47.62 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  50.82 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  43.87 
 
 		 281 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  43.87 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  51.76 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  54.3 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  52 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  48.38 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  45.71 
 
 		 345 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  45.71 
 
 		 345 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  46.09 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  45.21 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  46.65 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  45.05 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  38.77 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  44.19 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  40.86 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  37.39 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  33.56 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  43.43 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  38.49 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  35.58 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  37.24 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  40.99 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  38.51 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  35.4 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  33.13 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  38.98 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.01 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  36.93 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  31.42 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 		 504 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 500 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  29.83 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  25.63 
 
 		 425 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.92 
 
 		 398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  37.7 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 517 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  29.13 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  35.98 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  33.99 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  32.44 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  31.82 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  31.72 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  30.14 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  30.92 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  32.23 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  29.2 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  31.47 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  28.45 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>