More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2861 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  100 
 
 
345 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
345 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
348 aa  315  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  50.93 
 
 
350 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  46.95 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  48.01 
 
 
359 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  48.18 
 
 
340 aa  268  8e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 
349 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  46.04 
 
 
339 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  47.77 
 
 
336 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  47.26 
 
 
339 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  45.69 
 
 
354 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  46.18 
 
 
344 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  45.76 
 
 
334 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  48.14 
 
 
337 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  41.05 
 
 
328 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  41.05 
 
 
328 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  47.12 
 
 
337 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  41.49 
 
 
342 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  43.41 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  44.05 
 
 
332 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  40.74 
 
 
344 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  41.12 
 
 
328 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  41.02 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  45.08 
 
 
347 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  41.64 
 
 
331 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  41.64 
 
 
331 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  41.64 
 
 
331 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  41.64 
 
 
331 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  41.64 
 
 
331 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  40.99 
 
 
343 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  46.6 
 
 
357 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  42.15 
 
 
346 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  41.77 
 
 
345 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 
328 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  41.21 
 
 
333 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 
331 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  41.44 
 
 
334 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  40.98 
 
 
332 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  40.98 
 
 
332 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  41.09 
 
 
334 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  40.31 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  40.66 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 
335 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 
333 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  38.25 
 
 
281 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  38.25 
 
 
281 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  37.24 
 
 
335 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  43.65 
 
 
377 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  38.28 
 
 
329 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  33.13 
 
 
327 aa  189  7e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  36.59 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 
355 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  36.28 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  35.59 
 
 
330 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  31.06 
 
 
328 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  30.37 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  35.89 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  33.13 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  31.05 
 
 
371 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  34.01 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  29.43 
 
 
368 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 
505 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 
500 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  30.66 
 
 
331 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  29.91 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  33.22 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  30.79 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  31.12 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 
504 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  31.48 
 
 
314 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.12 
 
 
517 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  29.76 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  29.66 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  30.82 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  32.23 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  31.14 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  35.62 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.66 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 
389 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  29.62 
 
 
302 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  26.33 
 
 
368 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 
357 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  30.83 
 
 
313 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  27.32 
 
 
334 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.36 
 
 
347 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  30.03 
 
 
355 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 
355 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  27.67 
 
 
316 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  30.03 
 
 
355 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  30.03 
 
 
355 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  28.38 
 
 
357 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  30.6 
 
 
356 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>