More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1082 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  100 
 
 
302 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  46.24 
 
 
304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5637  hypothetical protein  42.91 
 
 
311 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  40.07 
 
 
310 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  36.72 
 
 
310 aa  192  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 
310 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  34.52 
 
 
330 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  33.11 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  31.62 
 
 
320 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.41 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  32.18 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  30.9 
 
 
354 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  32.19 
 
 
329 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  31.21 
 
 
339 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  30.23 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  27.73 
 
 
349 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  30.77 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 
333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  29.33 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.92 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.29 
 
 
333 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 
328 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  27.38 
 
 
348 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  41.8 
 
 
355 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.28 
 
 
328 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  28.14 
 
 
331 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.36 
 
 
328 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  29.49 
 
 
336 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.36 
 
 
328 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  28.25 
 
 
281 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  25.96 
 
 
354 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  27.64 
 
 
332 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  27.52 
 
 
326 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  28.25 
 
 
281 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  28.89 
 
 
321 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  27.99 
 
 
321 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.38 
 
 
368 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  26.1 
 
 
355 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  26.1 
 
 
355 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.1 
 
 
355 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  26.44 
 
 
355 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  26.1 
 
 
355 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  26.1 
 
 
355 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  26.1 
 
 
355 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  28.72 
 
 
337 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  29.62 
 
 
345 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  27.45 
 
 
355 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  29.62 
 
 
345 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  27.6 
 
 
357 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.56 
 
 
371 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  28.04 
 
 
337 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.76 
 
 
355 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  27.76 
 
 
477 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  27.56 
 
 
337 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  27.41 
 
 
346 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  28.16 
 
 
343 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  25.36 
 
 
365 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.45 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  27.45 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  27.45 
 
 
355 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  30.31 
 
 
356 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  25.56 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  38.17 
 
 
541 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.45 
 
 
355 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  27.27 
 
 
382 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  26.48 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  24.84 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  31.06 
 
 
425 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  28.04 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  25.68 
 
 
266 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  27.46 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 
354 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  26.47 
 
 
347 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 
541 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 
350 aa  93.2  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 
365 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  35.2 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  25.51 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  24.92 
 
 
358 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  27.42 
 
 
334 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  24.66 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  24.66 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  24.66 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  24.66 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  24.66 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  23.93 
 
 
352 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  24.83 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 
343 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.84 
 
 
339 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 
334 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 
343 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  26.57 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  27.12 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>