More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0123 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  58.58 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5637  hypothetical protein  46.1 
 
 		 311 aa  255  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  40.53 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  36.72 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  31.91 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  29.64 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  29.38 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  41.73 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.02 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  29.64 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 		 335 aa  99  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 329 aa  99  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 335 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  26.62 
 
 		 331 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.49 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.21 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  28.06 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  26.57 
 
 		 281 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  31.35 
 
 		 541 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  25.87 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  25.21 
 
 		 365 aa  89.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  26.18 
 
 		 477 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  26.67 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  26.67 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  25.52 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 		 541 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  27.3 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  26.64 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  26.35 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  25.33 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  24.09 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.04 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  25.86 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  25.57 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  23.51 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1043  HlyD family protein secretion protein  25.86 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  25.46 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  24.06 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  27.09 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  24.83 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  23.78 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  23.4 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  22.83 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  24.26 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  23.61 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  27.18 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  25.44 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  23.24 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  25.52 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  35.9 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  24.62 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  22.71 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  21.88 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  24.68 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  25.09 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  24.48 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  23.2 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  23.26 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.31 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  24.31 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  24.83 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  24.31 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  24.31 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  24.31 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  23.26 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  22.3 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  25.08 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  33.6 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  22.44 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  22.44 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  23.59 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  24.83 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  31.36 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.92 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  22.73 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  22.06 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  22.64 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  24.65 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  33 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  33 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>