More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1043 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1043  HlyD family protein secretion protein  100 
 
 
239 aa  493  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  40.98 
 
 
335 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 
328 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  26.04 
 
 
310 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  30.61 
 
 
331 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.15 
 
 
335 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5637  hypothetical protein  26.96 
 
 
311 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 
310 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  37.09 
 
 
355 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  38.25 
 
 
335 aa  85.1  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  36.42 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  25.65 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  26.29 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  32.1 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  24.73 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  22.45 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  36.07 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  24.72 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  25.91 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  26.35 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  26.35 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 
320 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0892  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.707751  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  26.48 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  37.1 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  28.46 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
541 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  25.28 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  33.73 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  28.3 
 
 
331 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  40.5 
 
 
368 aa  71.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  34.17 
 
 
541 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  23.89 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3111  secretion protein HlyD  31.82 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  25.55 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  24.08 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3305  secretion protein HlyD family protein  31.06 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  25.09 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  27.18 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  24.08 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  32.12 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  34.43 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  38.21 
 
 
395 aa  68.6  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  29.44 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  25.19 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  23.9 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3220  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  24.18 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  24.54 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  28.85 
 
 
356 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 
467 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  22.33 
 
 
382 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  24.91 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  26.64 
 
 
382 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.46 
 
 
354 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  22.97 
 
 
356 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  26.91 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  28.44 
 
 
397 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 
382 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  22.22 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  27.68 
 
 
354 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  26.09 
 
 
337 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 
409 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3718  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 
353 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  23.75 
 
 
319 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 
359 aa  62  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 
332 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  25.62 
 
 
477 aa  62  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 
359 aa  62  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  29.91 
 
 
357 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  29.91 
 
 
357 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  29.91 
 
 
357 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  22.46 
 
 
356 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  29.91 
 
 
357 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  22.37 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 
352 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  23.37 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  33.33 
 
 
355 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  33.33 
 
 
355 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
355 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  22.06 
 
 
359 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  33.33 
 
 
355 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 
336 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  33.33 
 
 
331 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  25.81 
 
 
287 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
355 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  23.19 
 
 
356 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  32.69 
 
 
355 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  32.69 
 
 
355 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>