More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2916 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  58.58 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5637  hypothetical protein  48.97 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  42.52 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  40.07 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  30.41 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.45 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  28.82 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.04 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.03 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  30.57 
 
 		 354 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.69 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  28.16 
 
 		 357 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 		 363 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  27.11 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  25.36 
 
 		 356 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  23.75 
 
 		 355 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  25.35 
 
 		 356 aa  89.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  27.03 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  23.44 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.44 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  23.44 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  23.44 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  23.44 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  23.44 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1043  HlyD family protein secretion protein  36.49 
 
 		 239 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.43 
 
 		 355 aa  85.9  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  24.47 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  26.73 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  23.59 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  23.56 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 541 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  28.95 
 
 		 541 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  25.75 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  24.64 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  22.22 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  24.32 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  24.32 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  24.83 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  25.78 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  25.68 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.2 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  23.99 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  37.82 
 
 		 477 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  24.16 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  39.81 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  23.66 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  26.33 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  26.13 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  23.69 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  24.24 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  37.96 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  25.81 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  22.22 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  23.63 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  22.22 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  22.22 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  25.77 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  23.1 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  23.08 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  23.08 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  24.63 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  24.91 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  25 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  22.74 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  22.33 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  24.92 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  22.74 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  22.74 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.01 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  22.01 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  24.47 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  21.32 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>