More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1914 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  100 
 
 
337 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  69.57 
 
 
331 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  70.72 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  49.67 
 
 
330 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  34.88 
 
 
335 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  35.91 
 
 
329 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  35.24 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  34.22 
 
 
329 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  35.25 
 
 
328 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  35.6 
 
 
333 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  47.22 
 
 
355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  34.87 
 
 
333 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  34.67 
 
 
332 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  35.4 
 
 
344 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  36.45 
 
 
334 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 
354 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  32.93 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  34.91 
 
 
328 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  34.91 
 
 
328 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  33.53 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  31.41 
 
 
344 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 
320 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  33.1 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  34.68 
 
 
344 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  36.33 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  30.86 
 
 
359 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  32.91 
 
 
331 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 
350 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  36.33 
 
 
337 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  35.15 
 
 
337 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  32.14 
 
 
339 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 
336 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  44.09 
 
 
541 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  31.31 
 
 
328 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  33 
 
 
334 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  45.16 
 
 
541 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  32.09 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.13 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  32.99 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  32.99 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  32.99 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  32.99 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  32.99 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  32.99 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  32.99 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  35.62 
 
 
340 aa  112  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  31.58 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  33.45 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  31.67 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.63 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.63 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  31.63 
 
 
331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  31.63 
 
 
331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  31.63 
 
 
331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  33.23 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  30.91 
 
 
343 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.74 
 
 
371 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  24.79 
 
 
365 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  32.28 
 
 
345 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  27.36 
 
 
328 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  29.92 
 
 
351 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  31.21 
 
 
356 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  26.92 
 
 
302 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  31.33 
 
 
346 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  33.75 
 
 
368 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  27.24 
 
 
326 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  28.42 
 
 
304 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  26.99 
 
 
372 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 
365 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  28.3 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  24.37 
 
 
425 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  31.01 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  27.69 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  34.62 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  30.25 
 
 
356 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  27.83 
 
 
374 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  27.38 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  28.06 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  28.31 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  37.96 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.18 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  27.89 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  30.15 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 
351 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 
351 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  27.36 
 
 
310 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  31.41 
 
 
363 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  27.58 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  27.58 
 
 
352 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  27.58 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.58 
 
 
352 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  27.58 
 
 
351 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 
390 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  28.53 
 
 
355 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>