More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0717 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  75 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  70.98 
 
 		 267 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  71.19 
 
 		 266 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  72.49 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  33.78 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  34.47 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  31.1 
 
 		 315 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  33 
 
 		 324 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  30.37 
 
 		 327 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  40.88 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  33.22 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  28.71 
 
 		 332 aa  128  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  28.71 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  39.89 
 
 		 326 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  45.8 
 
 		 321 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  46.98 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  29.61 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  29.28 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  27.69 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  44 
 
 		 320 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 		 328 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 320 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  44.72 
 
 		 328 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  26.47 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  42.11 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  31.08 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  31.08 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  29.29 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25.25 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 310 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  34.85 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0737  hypothetical protein  36.44 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.99 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  29.89 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.3 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  25.63 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.21 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  30.97 
 
 		 380 aa  75.1  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  26.37 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  25.98 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  30.11 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  29.11 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  29.11 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  24.55 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  28.93 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.67 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1043  HlyD family protein secretion protein  25.55 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  29.22 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  32.87 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  33.85 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0718  hypothetical protein  38.95 
 
 		 99 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.27 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  28.76 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  27.81 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  32.41 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  26.52 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0758  hypothetical protein  27.22 
 
 		 420 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.24 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.5 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  23.21 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1044  RND family efflux transporter MFP subunit  31.17 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0011899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  24.74 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  27.88 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>